Ganzgenom-basierte Analysen multiresistenter Klebsiella pneumoniae-Isolate aus Deutschland

Laura Antonia Becker
Die vorliegende Arbeit widmet sich der Ganzgenom-basierten Analyse ESBL- und Carbapenemase-produzierender K. pneumoniae-Isolate aus Deutschland. Im ersten Teilprojekt konnte durch Kombination von PacBio- und Illumina Miseq-Sequenzierung die Genomsequenz (Chromosom und drei Plasmide: 3,8kb, 4,8kb und 362kb) des CTX-M-15-produzierenden K. pneumoniae-Isolats 234/12 (ST514) rekonstruiert werden. Das Isolat 234/12 wurde im zweiten Schritt verwendet, um den Einfluss des DNA-Extraktionskits auf die anschließende Miseq-Sequenzierung zu untersuchen. Während die Wahl des Kits kaum Einfluss auf die Qualität der Sequenzierung...
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