ОПИСАНИЕ, ХАРАКТЕРИСТИКА И АЛГОРИТМ СОЗДАНИЯ СЛОВАРЯ КЛЕТОЧНЫХ ТИПОВ И ТКАНЕЙ В БАЗЕ ДАННЫХ GTRD

М.А. Куляшов, С.К. Колмыков, И.С. Евшин & Ф.А. Колпаков
База данных GTRD (http://gtrd.biouml.org) содержит информацию по сайтам связывания транскрипционных факторов и участкам открытого хроматина. Клеточные типы и ткани, представленные в GTRD, были: 1) упорядочены в единый словарь (3954 записей) 2) разделены на 90 уникальных кластеров 3) 3225 записей были сопоставлены с основными существующими базами данных клеточных типов 4) использованы для сопоставления экспериментов с базами данных по регуляции транскрипции: 588 для FANTOM 5, 5962 для ENCODE и 21720 для GTEx.
This data repository is not currently reporting usage information. For information on how your repository can submit usage information, please see our documentation.